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制度・料金の確認日:2026年10月29日。税制の説明は原則として2026年分の所得税を前提とします。
「せどりの記帳、freeeとマネーフォワードのどっちを使えばいい?」という疑問に、公認会計士・税理士の視点でお答えします。在庫・売上原価・販売手数料を押さえたうえで、自分の取引を記録しやすい道具を選びましょう。本記事は個人のせどりを想定し、マネーフォワードは個人向け「クラウド確定申告」を案内します。法人向け「クラウド会計」とは対象が異なります。
①なぜせどりは記帳でつまずきやすいのか?
せどり(転売ビジネス)は、商品を仕入れて販売する「物販」です。ブログやライターの副業と違い、仕入・在庫・販売手数料・送料といったお金の動きが細かく、取引件数も多くなりがちです。
所得税の計算では、売上だけでなく必要経費を差し引いた所得を把握します。売れ残った在庫まで仕入としてすべて経費にすると、所得が小さく計算される原因になります。消費税の課税や計算とは分けて確認しましょう。
- 取引件数が多い:1商品ごとに仕入・売上・手数料・送料が発生
- 販路が複数:Amazon、メルカリ、ヤフオク、楽天などでデータ形式がバラバラ
- 在庫がある:年末に残った商品の金額を把握する必要がある
- 私用と混ざりやすい:個人のクレジットカードで仕入れているケースが多い

仕入れたお金は全部経費だと思ってたぞ…違うのか?

そこが一番の落とし穴なんですよ!経費になるのは「その年に売れた分」の仕入だけなんです。
②せどり会計の基本「売上原価」と「棚卸」
せどりの利益計算で一番大切なのが売上原価です。売上原価とは「その年に売れた商品の仕入値」のことで、次の式で計算します。
売上原価 = 期首の在庫(1月1日) + 1年間の仕入 − 期末の在庫(12月31日)
| 項目 | 金額(例) | 説明 |
|---|---|---|
| 期首在庫 | 20万円 | 前年から繰り越した商品 |
| 当期の仕入 | 300万円 | 1年間に仕入れた商品 |
| 期末在庫 | 50万円 | 12月31日に残っている商品 |
| 売上原価 | 270万円 | 20万+300万−50万 |
この例では、期首在庫20万円と当期仕入300万円を合わせた320万円のうち、売上原価は270万円、期末在庫は50万円です。50万円は商品として翌年へ繰り越します。「当期仕入300万円の残りが50万円」という計算ではない点に注意しましょう。
棚卸の金額は、数量だけでなく評価方法もそろえて計算します。個人で評価方法を届け出ていない場合は原則として最終仕入原価法を使います。国税庁の棚卸表の記載案内を参考にし、対象年の手引きと自分の届出を確認してください。

年末に在庫を数えるのか…FBA倉庫にある分はどうするんだ?

FBA倉庫に保管している自分の商品も確認しましょう。発送途中の商品の帰属は契約や引渡しの条件などで変わるため、年末のレポートと取引資料を照合してくださいね。
期首20万円+当期仕入300万円=320万円
期末に残る在庫:50万円
売上原価:320万円−50万円=270万円
期末在庫は数量と評価方法を確認し、翌年へ繰り越します。
③freee会計とマネーフォワード クラウド確定申告の違い
freee会計とマネーフォワード クラウド確定申告は、個人の記帳・申告準備に使える選択肢です。明細の取り込みや入力を助ける機能があっても、売上総額、手数料、在庫の集計が正しいかを自分で確認する必要があります。
| 比較ポイント | freee会計 | マネーフォワード クラウド |
|---|---|---|
| 入力の考え方 | 「取引」単位で入力(操作感を試して確認) | 「仕訳」単位で入力(操作感を試して確認) |
| 選ぶときの確認 | 取引の登録・訂正から帳簿確認まで操作して比べる | 仕訳の登録・訂正から残高確認まで操作して比べる |
| 自動取込 | 口座・カード・各種サービスと連携 | 口座・カード・各種サービスと連携 |
| 在庫管理 | 年末に期末在庫を登録する運用が基本 | 年末に期末在庫を仕訳する運用が基本 |
| 確定申告 | 画面の質問に答えて申告書作成・e-Tax対応 | 決算書・申告書作成・e-Tax対応 |
商品ごとの数量・仕入単価は、在庫表や在庫管理ツールなどで把握し、会計の帳簿とつなげます。会計ソフトの導入だけで在庫管理が自動的に完了するわけではありません。必要な機能、対応する販売サービス、料金は公式情報で確認してください。

結局どっちがいいんだ?

簿記経験だけでは決まりません。同じ売上・手数料・入金を両方で記録し、修正や残高確認まで試してみると、自分に合う方が見えますよ。
料金は月払い・年払い・税込/税抜をそろえて比べ、領収書の読取件数、消費税申告、サポートの対象も確認してください。無料登録・試用と、期限なく使える有料プランの機能は別です。マネーフォワードの公式料金 / freeeの公式料金
④せどりの記帳手順と仕訳例
freeeでもマネーフォワードでも、せどりの記帳は次の流れで進めるとスムーズです。
- 事業用の口座・クレジットカードを連携する
- 自動仕訳ルールを作る(例:仕入先のカード明細→「仕入高」、配送業者→「荷造運賃」)
- 販路ごとの売上を入れる(Amazonはペイメントレポート、メルカリ等は販売履歴を使う)
- 毎月1回、未処理の明細がないか確認する
- 12月31日に棚卸をして、期末在庫を登録する
Amazon売上は「総額」で記帳する
Amazonからの入金は、手数料や送料が差し引かれた後の金額です。この入金額だけを売上にするのは誤りで、売上と手数料を分けて(両建てで)記帳します。
| 取引 | 借方 | 貸方 |
|---|---|---|
| 商品を5万円で仕入れ(カード払い) | 仕入高 50,000 | 未払金 50,000 |
| Amazonで商品が10万円売れた | 売掛金 100,000 | 売上高 100,000 |
| 販売手数料・FBA手数料 1.5万円 | 支払手数料 15,000 | 売掛金 15,000 |
| Amazonから入金 8.5万円 | 普通預金 85,000 | 売掛金 85,000 |
| 年末:期末在庫50万円を計上 | 商品 500,000 | 期末商品棚卸高 500,000 |
上の表は、消費税の区分を省略した単純な仕訳例です。実際の画面では、取引の総額・手数料・入金を対応付け、明細取込と手入力の二重計上を避けます。期首の在庫振替や返品・返金なども別途確認してください。

12月に売れて1月に入金された分はどうなるんだ?

一般的には入金日だけでは決めません。引渡しなど、取引に応じた売上の計上時期を確認し、未入金分は売掛金として整理します。出荷日と引渡し日を同じものと決めつけないでくださいね。
⑤せどり記帳のよくある間違い
せどりの帳簿を見ていると、次のようなミスをよく見かけます。どれも税務調査で指摘されやすいポイントです。
| よくある間違い | 何が問題か | 正しい対応 |
|---|---|---|
| 仕入を全額その年の経費にしている | 売れ残り分まで経費になり、利益が少なくなる | 年末に棚卸をして期末在庫を計上 |
| Amazonの入金額だけを売上にしている | 売上が少なく見え、消費税の判定もずれる | 売上と手数料を分けて記帳 |
| 入金日で売上を計上している | 年をまたぐ売上が翌年にずれる | 引渡しなど取引に応じた計上時期を確認 |
| 私用の買い物と仕入が混ざっている | 経費の根拠を説明できない | 事業用カードを分ける・私用は「事業主貸」 |
| フリマで個人から仕入れた記録がない | 仕入の証拠が残らない | 購入履歴の画面を保存し、相手・日付・品名・金額を記録 |
また、中古品を継続して仕入れて販売する場合は、古物商許可が必要になるケースがあります。許可の要否は管轄の警察署に確認しましょう。

全部やってた気がする…今からでも直せるのか?

まず資料と帳簿を照合して、直す範囲を確認しましょう。過去の申告にも影響するなら、必要な手続きを税理士に相談してくださいね。
⑥節税と効率化のポイント
青色申告の65万円控除を狙う
青色申告特別控除は、事前の承認申請、対象となる所得、帳簿・決算書、期限内申告などの要件によって10万円・55万円・65万円に分かれます。65万円には55万円控除の要件に加え、期限内のe-Tax申告、または届出を含む優良な電子帳簿の保存などが必要です。控除額がそのまま戻る税額になるわけではありません。国税庁「青色申告特別控除」
インボイス・電子帳簿保存法への対応
- 電子帳簿保存法:Amazonやネットショップの領収書など、データで受け取ったものはデータのまま保存します。クラウド会計のファイル保存機能を使うと管理が楽になります。
- インボイス(消費税):課税事業者の場合、古物商が一般の消費者から中古品を仕入れたときは、一定の事項を帳簿に書けばインボイスがなくても仕入税額控除ができる特例があります。
- 消費税の負担軽減措置:対象期間と適用要件を国税庁の最新案内で確認する。
- 免税事業者などからの仕入れ:経過措置の割合・期間・帳簿の要件を対象時点で確認する。
消費税の特例は登録時期や取引内容、対象年で適用が変わります。割合だけを覚えて処理せず、国税庁のインボイス制度特設サイトで最新の条件を確認してください。
経費にできるもの
送料・梱包資材・販売手数料・倉庫代・リサーチツール代・仕入れに行く交通費などは、事業との関係と計上時期を確認して記録します。自宅を兼用する家賃や電気代は、仕事に必要な部分を明確に区分します。国税庁「必要経費の知識」

65万円控除って、その分がそのまま戻ってくるのか?

控除は所得を計算するときに差し引くもので、戻る税額とは違います。ソフト代も、事業で使う範囲と費用の扱いを確認しましょう。
⑦公認会計士の実体験
私自身、せどりをしている方から「売上は増えているのに、利益がいくらなのか分からない」という相談を受けたことがあります。帳簿を確認すると、仕入はすべて経費に入っている一方、在庫の計上がなく、Amazonの売上も入金額だけで記帳されていました。販路ごとの売上レポートを使って総額で記帳し直し、年末の在庫を計上したところ、実際の利益は本人の感覚とかなり違っていました。せどりは「在庫」と「売上の総額」を押さえるだけで、帳簿の正確さが大きく変わります。公認会計士として、まずは事業用カードを1枚に絞り、クラウド会計の自動取込と毎月1回の見直しを習慣にすることをお勧めします。
keio-samurai(公認会計士・税理士)

儲かってると思ってたのに、実は違ったなんてこともあるのか…。

逆のパターンもあります。正しい数字が分かれば、仕入の判断もしやすくなるんですよ!
月末の照合例:売上・手数料・振込を一枚につなげる
会計ソフトの比較では、入力件数だけでなく、数字のずれを自分で説明できるかまで見ておきたいところです。以下は、消費税・返品・源泉徴収などを省いた架空の物販の月次例です。仕訳の結論を丸暗記するためではなく、確認する資料を整理するために使ってください。
| 照合するもの | 架空の金額 | 確認先 |
|---|---|---|
| 月の販売額 | 120,000円 | 販売履歴・売上レポート |
| 販売サービスが差し引く手数料 | 18,000円 | 手数料の明細 |
| 実際の振込額 | 102,000円 | 口座の入金明細 |
120,000円−18,000円=102,000円なので、この仮定では販売額から振込までがつながります。ただし、前月分の繰越や留保、返金があるサービスでは、この単純な差引きだけでは一致しません。差額を雑収入や経費で無理に埋めず、レポートの項目を確認します。
在庫表に残す項目と、年末に止まりやすいところ
| 在庫表の項目 | 残す理由 |
|---|---|
| 商品を識別できる情報 | 同じ商品を別名で二重に数えないため。 |
| 保管場所・数量 | 自宅と倉庫の両方にある商品の漏れを見つけるため。 |
| 仕入日・取得価額の資料 | 評価方法に従った金額と根拠を確かめるため。 |
| 返品・破損・移動の記録 | 帳簿上の数量と実物の差を説明するため。 |
倉庫へ送る途中、購入者へ発送した直後、返品が戻る前などは、単に「目の前にないから除く」と決めないようにします。契約・引渡し・返品処理の状況を確認し、判断に迷う分を別一覧に残しましょう。在庫の計上と評価は、商品の数量管理と税務処理を分けて確認します。
両ソフトの試用で同じ3点を確かめる
- 販売総額、差引手数料、入金を別々に追い、同じ取引を二重登録していないか。
- 一件の入力を訂正した後、帳簿と未入金残高がどう変わるか。
- 月の販売レポートと在庫表を、あとから見返せる形で保存できるか。
どちらか一方だけ手慣れた状態で比べると、機能の違いと慣れの差が混ざります。同じ架空取引と確認項目を使い、操作に迷ったところを記録してください。税務判断や評価方法が不明なときは、ソフトを変えて解決しようとせず、資料をそろえて確認しましょう。
⑧まとめ
せどりの記帳をfreee・マネーフォワード クラウド会計で効率化するポイントをまとめます。
- 経費になるのは「売れた分」の仕入だけ。12月31日の棚卸で期末在庫を計上する
- Amazon売上は総額で記帳し、手数料は「支払手数料」で分ける
- 売上の時期は引渡しなど取引の実態で確認し、年またぎの未入金分を記録する
- 同じ売上・手数料・入金を両方で処理し、自分が確認しやすい方を選ぶ
- 事業用の口座・カードを分け、自動取込+毎月の見直しを習慣にする
- 青色申告65万円控除・インボイス・電子帳簿保存法への対応も忘れずに
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自宅を仕事や在庫置き場に使う方は家事按分の計算方法も参考にしてください。


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